恭喜豪夫邁·羅氏有限公司M·庫克里卡獲國家專利權
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龍圖騰網恭喜豪夫邁·羅氏有限公司申請的專利識別高錯誤單分子讀段中的短基序的序列比對系統和方法獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN115698330B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-05-13發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202180038644.8,技術領域涉及:C12Q1/6869;該發明授權識別高錯誤單分子讀段中的短基序的序列比對系統和方法是由M·庫克里卡;B·劉設計研發完成,并于2021-05-26向國家知識產權局提交的專利申請。
本識別高錯誤單分子讀段中的短基序的序列比對系統和方法在說明書摘要公布了:本文描述了一種新穎的比對方法,所述比對方法利用多階段二級分析,每個階段逐漸減少下一個或多個階段要分析的數據量,但增加對從前一個或多個階段接收到的其余數據的搜索的詳盡性。這樣,可在一個或多個早期階段從最初的大型數據池中快速地識別噪聲較小的比對,而在一個或多個后期計算階段可從更小的數據池中同等快速地識別噪聲非常大的比對,從而保持靶靈敏度,同時減少總體計算時間。
本發明授權識別高錯誤單分子讀段中的短基序的序列比對系統和方法在權利要求書中公布了:1.一種用于將序列讀段與參考序列進行比對的方法,所述方法包括:使用第一種子長度利用Burrows-Wheeler變換將來自序列讀段整個群的序列讀段第一集合與參考序列進行比對,其中基于所述序列讀段的錯誤率選擇所述第一種子長度;掩蔽所述序列讀段第一集合,使得所述序列讀段整個群包括經掩蔽的序列讀段和非掩蔽的序列讀段的子集;使用第二種子長度利用所述Burrow-Wheeler變換將來自所述非掩蔽的序列讀段的序列讀段第二集合與所述參考序列進行比對,其中所述第二種子長度小于所述第一種子長度;以及基于所述序列讀段第一集合和所述序列讀段第二集合確定所述序列讀段與所述參考序列的比對;所述方法進一步包括迭代地掩蔽和比對序列讀段的另外集合與具有更小種子長度的讀段的每個后續集合,以及確定所述序列讀段與所述序列讀段的另外集合的比對;其中所述第一種子長度小于10個堿基,并且其中所述序列讀段的錯誤率為至少5%。
如需購買、轉讓、實施、許可或投資類似專利技術,可聯系本專利的申請人或專利權人豪夫邁·羅氏有限公司,其通訊地址為:瑞士巴塞爾;或者聯系龍圖騰網官方客服,聯系龍圖騰網可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網”。
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