深圳市合川醫(yī)療科技有限公司高雁獲國家專利權(quán)
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龍圖騰網(wǎng)獲悉深圳市合川醫(yī)療科技有限公司申請(qǐng)的專利高通量基因測序的并行處理同步優(yōu)化方法及系統(tǒng)獲國家發(fā)明授權(quán)專利權(quán),本發(fā)明授權(quán)專利權(quán)由國家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局授予,授權(quán)公告號(hào)為:CN119339799B 。
龍圖騰網(wǎng)通過國家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局官網(wǎng)在2025-03-25發(fā)布的發(fā)明授權(quán)授權(quán)公告中獲悉:該發(fā)明授權(quán)的專利申請(qǐng)?zhí)?專利號(hào)為:202411856517.0,技術(shù)領(lǐng)域涉及:G16B30/00;該發(fā)明授權(quán)高通量基因測序的并行處理同步優(yōu)化方法及系統(tǒng)是由高雁;劉輝;賀杰;曾禮江設(shè)計(jì)研發(fā)完成,并于2024-12-17向國家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局提交的專利申請(qǐng)。
本高通量基因測序的并行處理同步優(yōu)化方法及系統(tǒng)在說明書摘要公布了:本發(fā)明涉及一種高通量基因測序的并行處理同步優(yōu)化方法及系統(tǒng)。該方法:對(duì)多個(gè)DNA樣本進(jìn)行通道分配及信號(hào)采集初始化,得到信號(hào)采集參數(shù)矩陣;對(duì)各通道采集的熒光信號(hào)進(jìn)行特征提取和聚類分析,得到DNA堿基特征序列和信號(hào)分類概率矩陣;通過凸優(yōu)化算法對(duì)測序周期的短期參數(shù)進(jìn)行動(dòng)態(tài)調(diào)整,通過整數(shù)規(guī)劃算法對(duì)長期測序性能進(jìn)行優(yōu)化,得到測序參數(shù)優(yōu)化集和測序周期分配策略;將所述測序參數(shù)優(yōu)化集和所述測序周期分配策略輸入雙層嵌套控制模型,并通過上層資源分配網(wǎng)絡(luò)和下層參數(shù)優(yōu)化網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行聯(lián)合求解,得到全局優(yōu)化控制參數(shù)集。本發(fā)明的實(shí)施提升了測序準(zhǔn)確率,并且實(shí)現(xiàn)了計(jì)算資源利用率的提升。
本發(fā)明授權(quán)高通量基因測序的并行處理同步優(yōu)化方法及系統(tǒng)在權(quán)利要求書中公布了:1.一種高通量基因測序的并行處理同步優(yōu)化方法,其特征在于,包括以下步驟:對(duì)多個(gè)DNA樣本進(jìn)行通道分配及信號(hào)采集初始化,得到信號(hào)采集參數(shù)矩陣;根據(jù)所述信號(hào)采集參數(shù)矩陣對(duì)各通道采集的熒光信號(hào)進(jìn)行特征提取和聚類分析,得到DNA堿基特征序列和信號(hào)分類概率矩陣;基于所述DNA堿基特征序列和所述信號(hào)分類概率矩陣,通過凸優(yōu)化算法對(duì)測序周期的短期參數(shù)進(jìn)行動(dòng)態(tài)調(diào)整,通過整數(shù)規(guī)劃算法對(duì)長期測序性能進(jìn)行優(yōu)化,得到測序參數(shù)優(yōu)化集和測序周期分配策略;將所述測序參數(shù)優(yōu)化集和所述測序周期分配策略輸入雙層嵌套控制模型,并通過上層資源分配網(wǎng)絡(luò)和下層參數(shù)優(yōu)化網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行聯(lián)合求解,得到全局優(yōu)化控制參數(shù)集;具體包括:對(duì)所述測序參數(shù)優(yōu)化集進(jìn)行分層解耦,得到計(jì)算資源控制參數(shù)子集和測序性能控制參數(shù)子集,并將所述計(jì)算資源控制參數(shù)子集輸入上層資源分配網(wǎng)絡(luò),所述上層資源分配網(wǎng)絡(luò)包括資源調(diào)度層和任務(wù)分配層;基于所述測序周期分配策略構(gòu)建資源調(diào)度層優(yōu)化函數(shù),所述資源調(diào)度層包括4個(gè)調(diào)度單元,每個(gè)調(diào)度單元包含計(jì)算資源分配模塊和存儲(chǔ)資源分配模塊,得到初始資源分配方案;將所述初始資源分配方案輸入任務(wù)分配層,所述任務(wù)分配層包括任務(wù)分解單元和優(yōu)先級(jí)分配單元,所述任務(wù)分解單元對(duì)測序任務(wù)進(jìn)行子任務(wù)劃分,所述優(yōu)先級(jí)分配單元確定任務(wù)執(zhí)行順序,得到任務(wù)分配序列;將所述測序性能控制參數(shù)子集輸入下層參數(shù)優(yōu)化網(wǎng)絡(luò),所述下層參數(shù)優(yōu)化網(wǎng)絡(luò)包括參數(shù)更新層和性能評(píng)估層,并對(duì)所述參數(shù)更新層進(jìn)行多目標(biāo)優(yōu)化求解,所述參數(shù)更新層包括6個(gè)優(yōu)化單元,每個(gè)優(yōu)化單元包含參數(shù)生成模塊和約束檢驗(yàn)?zāi)K,得到參數(shù)更新方案;將所述參數(shù)更新方案輸入性能評(píng)估層,所述性能評(píng)估層包括性能指標(biāo)計(jì)算單元和誤差補(bǔ)償單元,得到優(yōu)化參數(shù)方案;將所述任務(wù)分配序列和所述優(yōu)化參數(shù)方案輸入雙層協(xié)同優(yōu)化器,通過上下層交互迭代運(yùn)算得到全局優(yōu)化控制參數(shù)集。
如需購買、轉(zhuǎn)讓、實(shí)施、許可或投資類似專利技術(shù),可聯(lián)系本專利的申請(qǐng)人或?qū)@麢?quán)人深圳市合川醫(yī)療科技有限公司,其通訊地址為:518000 廣東省深圳市龍華區(qū)大浪街道華興路中建工業(yè)區(qū)2棟1-2樓;或者聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)官方客服,聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網(wǎng)”。
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