恭喜賽業(廣州)生物科技有限公司高翠獲國家專利權
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龍圖騰網恭喜賽業(廣州)生物科技有限公司申請的專利一種基于堿基突變影響mRNA剪接的預測方法、系統及平臺獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN114613431B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-03-21發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202111385652.8,技術領域涉及:G16B20/50;該發明授權一種基于堿基突變影響mRNA剪接的預測方法、系統及平臺是由高翠;王倫基;陳汕;韓藍青設計研發完成,并于2021-11-22向國家知識產權局提交的專利申請。
本一種基于堿基突變影響mRNA剪接的預測方法、系統及平臺在說明書摘要公布了:本發明屬于堿基突變剪接技術領域,具體涉及一種基于堿基突變影響mRNA剪接的預測方法、系統及平臺。通過一種基于堿基突變影響mRNA剪接的預測方法:獲取堿基突變數據信息,并對所述堿基突變數據信息實時轉換處理;構建AI模型,通過所述AI模型對突變前后的序列進行剪切預測,并實時生成剪接模型預測數據;實時對所述預測數據進行分析處理,并可視化展示分析處理最終數據,以及相應地系統、平臺,能預測堿基突變帶來的轉錄本切割的改變,通過AI模型預測剪切位置再通過分析可能的剪切方式和轉錄產物,可視化展示,操作方便,速度迅速,結果簡單易理解,同時也為研究人員提供一種工具去探究此類突變的致病根本原因等相關研究。
本發明授權一種基于堿基突變影響mRNA剪接的預測方法、系統及平臺在權利要求書中公布了:1.一種基于堿基突變影響mRNA剪接的預測方法,其特征在于所述方法具體包括如下步驟:獲取堿基突變數據信息,并對所述堿基突變數據信息實時轉換處理;構建AI模型,通過所述AI模型對突變前后的序列進行剪切預測,并實時生成剪接模型預測數據,包括:構建訓練數據集,并實時生成序列長度;對所述序列編碼處理,并實時構建生成AI模型;將序列以生成序列長度每跨度1bp切割成短序列,并對所述短序列實時編碼處理;根據構建的AI模型,對編碼處理后的短序列實時進行數據預測;其中,AI模型預測序列切割位置訓練具體包括以下步驟:S021、制作訓練數據集,序列長度為l;X:基因間序列,N:外顯子序列,n:內含子序列非切割位置:基因間、外顯子上和內含子上;剪接供體:跨外顯子和內含子,l2長度在外顯子上,l2長度在內含子上;剪接受體:跨內含子和外顯子,l2長度在內含子上,l2長度在外顯子上;S022、對序列進行one-hot編碼;S023、訓練AI模型;實時對所述預測數據進行分析處理,并可視化展示分析處理最終數據,包括:判定原切割位置是否改變了切割類型分類;獲取剪接供體位置及剪接受體位置,并生成預測值峰值位置;判定剪接供體或受體附近突變發生類型,生成最終的剪接方式數據信息,并對所述最終剪接方式數據信息進行解析處理。
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