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龍圖騰網(wǎng)恭喜密歇根大學董事會申請的專利用于分析染色質相互作用數(shù)據(jù)的方法和設備獲國家發(fā)明授權專利權，本發(fā)明授權專利權由國家知識產(chǎn)權局授予，授權公告號為：CN112272849B 。

龍圖騰網(wǎng)通過國家知識產(chǎn)權局官網(wǎng)在2025-06-27發(fā)布的發(fā)明授權授權公告中獲悉：該發(fā)明授權的專利申請?zhí)?專利號為：201980034320.X，技術領域涉及：G16B20/00；該發(fā)明授權用于分析染色質相互作用數(shù)據(jù)的方法和設備是由A·阿林-富伊爾;B·D·阿西;G·A·希金斯;A·阿德設計研發(fā)完成，并于2019-03-21向國家知識產(chǎn)權局提交的專利申請。

本用于分析染色質相互作用數(shù)據(jù)的方法和設備在說明書摘要公布了：為了分析染色質的空間組織，計算裝置可以使用二叉搜索樹將基因組元件觸點或讀段編譯到可變大小的箱中。所述箱可被選擇用于各自表示基因組內(nèi)不同的切割位點增量或功能元件，如基因、TAD、染色質狀態(tài)片段、環(huán)狀結構域、染色質結構域等。選擇兩組箱來生成箱對的正方形基因組矩陣，其中每個組表示所述矩陣的軸。然后將歸一化方法應用于具有可變大小和或形狀的所述箱對的相互作用頻率以生成每個箱對的經(jīng)歸一化的相互作用頻率。可以使用所述經(jīng)歸一化的相互作用頻率來識別具有富集的觸點和貧化的觸點的箱對，以進行各種分析，包含基因組變體的靶基因的檢測，以及觸點的全基因組分析。

本發(fā)明授權用于分析染色質相互作用數(shù)據(jù)的方法和設備在權利要求書中公布了：1.一種用于分析染色質的空間和時間組織的計算機實施的方法，所述方法由被編程為執(zhí)行所述方法的一個或多個處理器執(zhí)行，所述方法包括： 在一個或多個處理器處獲得基因組元件的一組成對觸點； 由所述一個或多個處理器將基因組元件分割成多個箱，其中所述多個箱的箱大小不一致； 由所述一個或多個處理器識別第一組所述多個箱和第二組所述多個箱； 由所述一個或多個處理器生成n×m個箱對的矩陣，其中n對應于所述第一組所述多個箱，并且m對應于所述第二組所述多個箱； 由所述一個或多個處理器識別所述箱對中的每個箱對內(nèi)的成對觸點的子集； 由所述一個或多個處理器確定所述箱對中的每個箱對的相互作用頻率； 由所述一個或多個處理器對所述相互作用頻率中的每個相互作用頻率進行歸一化以生成每個箱對的經(jīng)歸一化的相互作用頻率；以及 由所述一個或多個處理器提供染色質相互作用的映射以在用戶界面上顯示，包含對所述箱對的指示和對經(jīng)歸一化的相互作用頻率的相應指示，其中對所述相互作用頻率中的每個相互作用頻率進行歸一化包含： 由所述一個或多個處理器確定所述一組成對觸點的密度隨基因組距離的變化以生成密度函數(shù)； 對于所述多個箱對中的每個箱對： 由所述一個或多個處理器對所述箱對的區(qū)域上的密度函數(shù)進行積分以確定所述箱對的預期密度； 由所述一個或多個處理器通過使用泊松統(tǒng)計分布執(zhí)行統(tǒng)計分析來將所述箱對內(nèi)的成對觸點的所述子集與所述箱對的所述預期密度進行比較，以確定所述箱對的實際密度大于所述箱對的所述預期密度的量明顯顯著的似然度； 由所述一個或多個處理器將用于多重比較控制的錯誤發(fā)現(xiàn)率應用于所確定的似然度以確定經(jīng)過調(diào)整的似然度；以及 當經(jīng)過調(diào)整的似然度小于閾值似然度時，由所述一個或多個處理器確定所述箱對具有富集的觸點。

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