恭喜深圳北鯤云計(jì)算有限公司馮建新獲國(guó)家專利權(quán)
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龍圖騰網(wǎng)恭喜深圳北鯤云計(jì)算有限公司申請(qǐng)的專利一種GPU并行計(jì)算分子相似度方法、裝置、系統(tǒng)及介質(zhì)獲國(guó)家發(fā)明授權(quán)專利權(quán),本發(fā)明授權(quán)專利權(quán)由國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局授予,授權(quán)公告號(hào)為:CN114520022B 。
龍圖騰網(wǎng)通過國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局官網(wǎng)在2025-06-10發(fā)布的發(fā)明授權(quán)授權(quán)公告中獲悉:該發(fā)明授權(quán)的專利申請(qǐng)?zhí)?專利號(hào)為:202210144227.8,技術(shù)領(lǐng)域涉及:G16B15/00;該發(fā)明授權(quán)一種GPU并行計(jì)算分子相似度方法、裝置、系統(tǒng)及介質(zhì)是由馮建新;李青松設(shè)計(jì)研發(fā)完成,并于2022-02-17向國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局提交的專利申請(qǐng)。
本一種GPU并行計(jì)算分子相似度方法、裝置、系統(tǒng)及介質(zhì)在說明書摘要公布了:本發(fā)明公開了一種GPU并行計(jì)算分子相似度方法、裝置、系統(tǒng)及介質(zhì),方法包括以下步驟:輸入查詢化合物;計(jì)算查詢化合物的質(zhì)心;基于質(zhì)心對(duì)查詢化合物進(jìn)行平移和或旋轉(zhuǎn)變換;通過GPU進(jìn)行并行計(jì)算,將變換前后的查詢化合物均作為起始搜索點(diǎn)與分子庫中的分子化合物進(jìn)行比對(duì);根據(jù)比對(duì)的計(jì)算結(jié)果進(jìn)行過濾,輸出與查詢化合物相似的分子化合物。
本發(fā)明授權(quán)一種GPU并行計(jì)算分子相似度方法、裝置、系統(tǒng)及介質(zhì)在權(quán)利要求書中公布了:1.一種GPU并行計(jì)算分子相似度方法,其特征在于,包括以下步驟:輸入查詢化合物的三維結(jié)構(gòu)信息,所述三維結(jié)構(gòu)信息包括查詢化合物中每個(gè)原子的類型及其坐標(biāo)數(shù)值,通過高斯函數(shù)表示查詢化合物的體積;基于查詢化合物的三維結(jié)構(gòu)信息,計(jì)算查詢化合物的質(zhì)心,且進(jìn)行SVD分解,計(jì)算3D旋轉(zhuǎn)矩陣;對(duì)查詢化合物進(jìn)行平移和或旋轉(zhuǎn)變換,通過一組四元組數(shù)據(jù)記錄查詢化合物的平移和或旋轉(zhuǎn)變換;通過GPU進(jìn)行并行計(jì)算,將查詢化合物的高斯函數(shù)和記錄化合物位移的四元組加載進(jìn)GPU內(nèi)存,將變換前后的查詢化合物均作為起始搜索點(diǎn)與分子庫中的分子化合物進(jìn)行比,GPU的多個(gè)算點(diǎn)運(yùn)行最優(yōu)化算法,計(jì)算查詢化合物與分子庫內(nèi)分子化合物之間的3D高斯疊加;根據(jù)比對(duì)的計(jì)算結(jié)果進(jìn)行過濾,輸出與查詢化合物相似的分子化合物。
如需購買、轉(zhuǎn)讓、實(shí)施、許可或投資類似專利技術(shù),可聯(lián)系本專利的申請(qǐng)人或?qū)@麢?quán)人深圳北鯤云計(jì)算有限公司,其通訊地址為:518107 廣東省深圳市光明區(qū)鳳凰街道塘尾社區(qū)恒泰裕大廈1棟504;或者聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)官方客服,聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網(wǎng)”。
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