恭喜煥一生物科技(杭州)有限公司孫迪獲國家專利權(quán)
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龍圖騰網(wǎng)恭喜煥一生物科技(杭州)有限公司申請的專利通路數(shù)據(jù)庫拓展方法、系統(tǒng)、存儲介質(zhì)及電子設(shè)備獲國家發(fā)明授權(quán)專利權(quán),本發(fā)明授權(quán)專利權(quán)由國家知識產(chǎn)權(quán)局授予,授權(quán)公告號為:CN119007827B 。
龍圖騰網(wǎng)通過國家知識產(chǎn)權(quán)局官網(wǎng)在2025-05-23發(fā)布的發(fā)明授權(quán)授權(quán)公告中獲悉:該發(fā)明授權(quán)的專利申請?zhí)?專利號為:202411488692.9,技術(shù)領(lǐng)域涉及:G16B40/00;該發(fā)明授權(quán)通路數(shù)據(jù)庫拓展方法、系統(tǒng)、存儲介質(zhì)及電子設(shè)備是由孫迪;陳樂敏;蔡俊杰;文雯;閆子玥設(shè)計研發(fā)完成,并于2024-10-24向國家知識產(chǎn)權(quán)局提交的專利申請。
本通路數(shù)據(jù)庫拓展方法、系統(tǒng)、存儲介質(zhì)及電子設(shè)備在說明書摘要公布了:本申請?zhí)峁┮环N通路數(shù)據(jù)庫拓展方法、系統(tǒng)、存儲介質(zhì)及電子設(shè)備。所述通路數(shù)據(jù)庫拓展方法包括:獲取脂質(zhì)通路數(shù)據(jù)庫的脂質(zhì)?通路注釋關(guān)系;根據(jù)脂質(zhì)分類體系獲取脂質(zhì)層級信息;根據(jù)所述脂質(zhì)層級信息對所述脂質(zhì)?通路注釋關(guān)系進(jìn)行拓展,其中,對于任一父級脂質(zhì),若所述父級脂質(zhì)被注釋到第一通路,則將所述父級脂質(zhì)的所有子級脂質(zhì)均注釋到所述第一通路。所述通路數(shù)據(jù)庫拓展方法能夠提升脂質(zhì)識別和映射的準(zhǔn)確性。
本發(fā)明授權(quán)通路數(shù)據(jù)庫拓展方法、系統(tǒng)、存儲介質(zhì)及電子設(shè)備在權(quán)利要求書中公布了:1.一種基于脂質(zhì)層級信息的通路數(shù)據(jù)庫拓展方法,其特征在于,包括:獲取脂質(zhì)通路數(shù)據(jù)庫的脂質(zhì)-通路注釋關(guān)系;根據(jù)脂質(zhì)分類體系獲取脂質(zhì)層級信息;根據(jù)所述脂質(zhì)層級信息對所述脂質(zhì)-通路注釋關(guān)系進(jìn)行拓展,其中,對于任一父級脂質(zhì),若所述父級脂質(zhì)被注釋到第一通路,則將所述父級脂質(zhì)的所有子級脂質(zhì)均注釋到所述第一通路;對于所述脂質(zhì)通路數(shù)據(jù)庫中的任一第二通路,獲取所述第二通路對應(yīng)于檢測脂質(zhì)的節(jié)點重要性因子;獲取所述第二通路對應(yīng)于所述檢測脂質(zhì)的覆蓋率調(diào)整因子和拓?fù)湔{(diào)整因子;根據(jù)所述節(jié)點重要性因子、所述覆蓋率調(diào)整因子和所述拓?fù)湔{(diào)整因子獲取所述第二通路的通路得分;其中,獲取所述第二通路對應(yīng)于檢測脂質(zhì)的節(jié)點重要性因子包括:獲取所述第二通路中節(jié)點的重要性調(diào)整因子;對于所述第二通路中的每個節(jié)點,獲取與其匹配的所述檢測脂質(zhì);獲取每個匹配脂質(zhì)的個體影響因子;根據(jù)所述個體影響因子和所述重要性調(diào)整因子獲取所述節(jié)點重要性因子;獲取所述第二通路對應(yīng)于所述檢測脂質(zhì)的覆蓋率調(diào)整因子包括:獲取所述檢測脂質(zhì)的數(shù)量與所述第二通路中的節(jié)點數(shù)量之間的商作為初始覆蓋率;根據(jù)所述初始覆蓋率獲取所述覆蓋率調(diào)整因子;獲取所述第二通路對應(yīng)于所述檢測脂質(zhì)的拓?fù)湔{(diào)整因子包括:識別所述第二通路中的線性路徑和分支節(jié)點;根據(jù)所述線性路徑中節(jié)點的變化情況和或所述分支節(jié)點的變化情況配置所述拓?fù)湔{(diào)整因子;獲取所述第二通路中節(jié)點的重要性調(diào)整因子包括:獲取所述第二通路中節(jié)點的歸一化度中心性;將所述歸一化度中心性映射到目標(biāo)區(qū)間以得到所述重要性調(diào)整因子;對于匹配脂質(zhì)i,其個體影響因子IF_i可以通過下式得到:IF_i=log2FC_i*-log10p_value_i*W_i;其中,log2FC_i用來衡量在不同實驗條件下所述匹配脂質(zhì)i的表達(dá)水平的變化程度,p_value_i是所述匹配脂質(zhì)i的p值,用于評估觀察到的實驗數(shù)據(jù)與統(tǒng)計假設(shè)之間的顯著性水平,W_i為所述匹配脂質(zhì)i的匹配權(quán)重,若所述匹配脂質(zhì)i與某個節(jié)點直接匹配則W_i=1,否則W_i=0.8。
如需購買、轉(zhuǎn)讓、實施、許可或投資類似專利技術(shù),可聯(lián)系本專利的申請人或?qū)@麢?quán)人煥一生物科技(杭州)有限公司,其通訊地址為:311100 浙江省杭州市臨平區(qū)東湖街道新顏路22號7幢209A;或者聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)官方客服,聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網(wǎng)”。
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