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龍圖騰網恭喜金鳳實驗室申請的專利細胞數據綜合分析系統獲國家發明授權專利權，本發明授權專利權由國家知識產權局授予，授權公告號為：CN116959583B 。

龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-05-20發布的發明授權授權公告中獲悉：該發明授權的專利申請號/專利號為：202310670920.3，技術領域涉及：G16B40/00；該發明授權細胞數據綜合分析系統是由王崢設計研發完成，并于2023-06-07向國家知識產權局提交的專利申請。

本細胞數據綜合分析系統在說明書摘要公布了：本申請提供一種細胞數據綜合分析系統，涉及細胞數據處理技術領域。該系統包括獲取模塊、過濾模塊、批效應消除模塊、雙胞剔除模塊、細胞間通訊分析模塊、聚類模塊、細胞注釋模塊及可視化模塊。其中，獲取模塊、過濾模塊、批效應消除模塊、雙胞剔除模塊可以對基于單細胞組學產生的數據集進行各類預處理操作，如進行細胞濾除、批效應消除、雙胞剔除等，而通過預處理操作可以提高數據的有效性與可靠性。另外，細胞間通訊分析模塊、聚類模塊、細胞注釋模塊及可視化模塊，能夠支持細胞通訊分析、降維聚類、細胞注釋、可視化顯示等處理操作，能豐富分析功能，提高數據分析的靈活性，進而有利于提高數據分析的效率。

本發明授權細胞數據綜合分析系統在權利要求書中公布了：1.一種細胞數據綜合分析系統，其特征在于，所述系統包括：獲取模塊、過濾模塊、批效應消除模塊、雙胞剔除模塊、細胞間通訊分析模塊、聚類模塊、細胞注釋模塊及可視化模塊；所述獲取模塊獲取用戶上傳的基于單細胞組學產生的第一數據集，所述第一數據集中的數據格式包括tsv格式、txt格式、csv格式、RDS格式及HDF5格式；所述過濾模塊在接收到預處理指令時，基于用戶設置的用于過濾細胞的指標數據，對所述第一數據集進行過濾，得到第二數據集，所述指標數據包括UMI計數的第一閾值范圍、特征基因計數的第二閾值范圍、線粒體基因百分比的第三閾值范圍和與β-action表達對應的第四閾值范圍；所述批效應消除模塊調用批效應消除工具，以對所述第二數據集進行批效應消除，得到第三數據集；所述雙胞剔除模塊通過調用DoubletFinder工具，以對所述第三數據集進行雙胞剔除，得到第四數據集；所述細胞間通訊分析模塊在接收到用于細胞間通訊分析的第一指令時，從工具庫中調用預先設置的CellPhoneDB工具、CellChat工具和Cellcall工具，并通過所述CellPhoneDB工具、所述CellChat工具和所述Cellcall工具確定所述第四數據集中細胞間相互作用的強度和配體受體的差異對，以得到表征細胞間通訊的通訊分析結果；所述聚類模塊在接收到用于細胞類型注釋的第二指令時，從所述工具庫中調用預先設置的降維聚類工具，以對所述第四數據集進行降維聚類，得到聚類后的第五數據集，其中，所述降維聚類工具包括PCA工具、SC3工具、tSNE工具及UMAP工具；所述細胞注釋模塊通過調用所述工具庫中的注釋工具，對所述第五數據集進行細胞類型注釋，得到注釋結果，其中，所述注釋工具包括SingleR工具、基于加權最近鄰網絡算法的圖譜注釋工具中的任一種；所述可視化模塊基于預設可視化策略，對所述通訊分析結果、所述注釋結果進行可視化展示；所述系統還包括：選擇模塊，用于從所述第五數據集中選擇期望關注的細胞類型的細胞數據作為待測細胞；評估模塊，用于通過預設算法，確定所述待測細胞的指定通路矯正后的F得分；分群獲取模塊，用于基于所述矯正后的F得分，從所述待測細胞中獲取細胞亞類的分群信息；輸入模塊，用于將從所述待測細胞得到的細胞亞類數據，輸入預先創建的單細胞通路富集模塊，所述細胞亞類數據包括基因原始表達矩陣、高變基因列表及所述細胞亞類的分群信息；富集分析模塊，用于調用所述單細胞通路富集模塊中的clusterProfiler工具，將所述細胞亞類數據中的高變基因列表作為輸入數據，并進行GO富集分析，得到富集分析結果，所述富集分析結果包括GO富集結果、FDRp-value，以及通路所包含的基因信息；所述預設算法為如下公式： 其中，bgratio指背景值，Ngenesinacell指所述待測細胞中檢測到的基因數量，Ntotalgenes指樣品檢測到的基因總數，fgratio指前景值，Ngenesfromaterminacell指所述待測細胞中檢測到的指定通路的基因數量，Ntotalgenesofaterm指所述指定通路的全部基因數量，Fscore指所述待測細胞的指定通路的F得分，adjFscore指所述待測細胞的指定通路矯正后的F得分，Qterm指通過FDR矯正后的p值，Qterm由clusterProfiler工具計算獲得；所述過濾模塊還用于：基于用戶通過第一條形滑動按鈕設置的UMI計數的所述第一閾值范圍，濾除所述第一數據集中UMI計數未在所述第一閾值范圍內的數據；基于用戶通過第二條形滑動按鈕設置的特征基因計數的所述第二閾值范圍，濾除所述第一數據集中特征基因計數未在所述第二閾值范圍內的數據；基于用戶通過第三條形滑動按鈕設置的線粒體基因百分比的所述第三閾值范圍，濾除所述第一數據集中線粒體基因百分比未在所述第三閾值范圍內的數據；基于用戶通過第四條形滑動按鈕設置的與β-action表達對應的所述第四閾值范圍，濾除所述第一數據集中β-action表達未在所述第四閾值范圍內的數據，其中，在所述第一條形滑動按鈕、所述第二條形滑動按鈕、所述第三條形滑動按鈕以及所述第四條形滑動按鈕中，單個條形滑動按鈕不同長度對應不同的值；將經過UMI計數、特征基因計數、線粒體基因百分比和β-action表達過濾的第一數據集作為所述第二數據集。

如需購買、轉讓、實施、許可或投資類似專利技術，可聯系本專利的申請人或專利權人金鳳實驗室，其通訊地址為：401329 重慶市九龍坡區金玥路313號金鳳實驗室；或者聯系龍圖騰網官方客服，聯系龍圖騰網可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網”。