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龍圖騰網(wǎng)恭喜廣州基迪奧生物科技有限公司申請的專利一種基于單細胞全轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)的分析方法、系統(tǒng)、裝置獲國家發(fā)明授權(quán)專利權(quán)，本發(fā)明授權(quán)專利權(quán)由國家知識產(chǎn)權(quán)局授予，授權(quán)公告號為：CN118866127B 。

龍圖騰網(wǎng)通過國家知識產(chǎn)權(quán)局官網(wǎng)在2025-04-18發(fā)布的發(fā)明授權(quán)授權(quán)公告中獲悉：該發(fā)明授權(quán)的專利申請?zhí)?專利號為：202411078942.1，技術(shù)領(lǐng)域涉及：G16B50/10；該發(fā)明授權(quán)一種基于單細胞全轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)的分析方法、系統(tǒng)、裝置是由周煌凱;高川;艾鵬;孫鵬鵬設(shè)計研發(fā)完成，并于2024-08-07向國家知識產(chǎn)權(quán)局提交的專利申請。

本一種基于單細胞全轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)的分析方法、系統(tǒng)、裝置在說明書摘要公布了：本申請實施例公開了一種基于單細胞全轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)的分析方法、系統(tǒng)、裝置，其包括以下步驟，lncRNA分析：選擇lncRNA注釋比對參考，將比對到基因組上的reads組裝成轉(zhuǎn)錄本，基于轉(zhuǎn)錄本進行分析，發(fā)現(xiàn)新的lncRNA分子并確定lncRNA的基本特性；單細胞全轉(zhuǎn)錄組定量分析：將reads與參考基因組進行比對，將reads注釋為特定基因；再對UMI進行修正和統(tǒng)計后，獲得未過濾的feature?barcode矩陣；亞群上調(diào)表達基因分析：各個亞群篩選特異表達的基因marker，采用seurat的秩和檢驗對不同細胞亞群進行差異基因表達分析，篩選每個細胞亞群上調(diào)表達的基因。本申請解決現(xiàn)有技術(shù)中對單細胞全轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)，即scFAST?seq數(shù)據(jù)分析不夠全面具體和涉及范圍不夠廣泛的問題。

本發(fā)明授權(quán)一種基于單細胞全轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)的分析方法、系統(tǒng)、裝置在權(quán)利要求書中公布了：1.一種基于單細胞全轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)的分析方法，其特征在于，其包括以下步驟：lncRNA分析：選擇lncRNA注釋比對參考，將比對到基因組上的reads組裝成轉(zhuǎn)錄本，基于轉(zhuǎn)錄本進行分析，發(fā)現(xiàn)新的lncRNA分子并確定lncRNA的基本特性；具體包括1lncRNA分子注釋：以樣本對應(yīng)的物種的基因組或已知的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)作為注釋比對參考，使用HISAT2軟件進行基于參考基因組的比對；2新lncRNA預測和鑒定：基于stringtie轉(zhuǎn)錄組分析軟件重構(gòu)轉(zhuǎn)錄本；保留轉(zhuǎn)錄本長度≥200bp且exon數(shù)目≥2，使用CPC2、CNCI、feelnc三個軟件預測新轉(zhuǎn)錄本的編碼能力，借助CPC2、CNCI、feelnc軟件進行新lncRNA預測新轉(zhuǎn)錄本的編碼能力，取沒有編碼潛能轉(zhuǎn)錄本交集作為可靠的預測結(jié)果；以3個軟件的交集作為判斷最終的lncRNA預測結(jié)果，并對預測結(jié)果進行鑒定；3lncRNA轉(zhuǎn)錄本分類：根據(jù)新lncRNA在基因組上相對于蛋白編碼基因的位置，可以將新lncRNAs劃分為基因間區(qū)長鏈非編碼lncRNA、雙向長鏈非編碼lncRNA、內(nèi)含子長鏈非編碼RNA、反義長鏈非編碼RNA和正義長鏈非編碼RNA；4lncRNA表達分析：使用SeekSoulTools將注釋為lncRNA的reads通過對UMI進行修正后統(tǒng)計表達定量，確定樣本中檢出的lncRNA數(shù)量；單細胞全轉(zhuǎn)錄組定量分析：將reads與參考基因組進行比對，將reads注釋為特定基因；再對UMI進行修正和統(tǒng)計后，獲得未過濾的feature-barcode矩陣；亞群上調(diào)表達基因分析：各個亞群篩選特異表達的基因marker，采用seurat的秩和檢驗對不同細胞亞群進行差異基因表達分析，篩選每個細胞亞群上調(diào)表達的基因。

如需購買、轉(zhuǎn)讓、實施、許可或投資類似專利技術(shù)，可聯(lián)系本專利的申請人或?qū)＠麢?quán)人廣州基迪奧生物科技有限公司，其通訊地址為：510005 廣東省廣州市黃埔區(qū)國際生物島螺旋三路12號第七層703單元；或者聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)官方客服，聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網(wǎng)”。