北方工業(yè)大學(xué)李源獲國家專利權(quán)
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龍圖騰網(wǎng)獲悉北方工業(yè)大學(xué)申請的專利面向基因組動態(tài)交互網(wǎng)絡(luò)的稠密子圖查詢挖掘方法及系統(tǒng)獲國家發(fā)明授權(quán)專利權(quán),本發(fā)明授權(quán)專利權(quán)由國家知識產(chǎn)權(quán)局授予,授權(quán)公告號為:CN117612606B 。
龍圖騰網(wǎng)通過國家知識產(chǎn)權(quán)局官網(wǎng)在2025-04-15發(fā)布的發(fā)明授權(quán)授權(quán)公告中獲悉:該發(fā)明授權(quán)的專利申請?zhí)?專利號為:202311520507.5,技術(shù)領(lǐng)域涉及:G16B40/00;該發(fā)明授權(quán)面向基因組動態(tài)交互網(wǎng)絡(luò)的稠密子圖查詢挖掘方法及系統(tǒng)是由李源;孔慶欣設(shè)計研發(fā)完成,并于2023-11-15向國家知識產(chǎn)權(quán)局提交的專利申請。
本面向基因組動態(tài)交互網(wǎng)絡(luò)的稠密子圖查詢挖掘方法及系統(tǒng)在說明書摘要公布了:本發(fā)明公開了一種面向基因組動態(tài)交互網(wǎng)絡(luò)的稠密子圖查詢挖掘方法及系統(tǒng),涉及基因組數(shù)據(jù)分析領(lǐng)域,該方法包括:基于置換檢驗的方法構(gòu)建基因組動態(tài)交互網(wǎng)絡(luò);基于網(wǎng)絡(luò)存儲模型和網(wǎng)絡(luò)劃分策略,對基因組動態(tài)交互網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行分布式存儲;對存儲后的基因組動態(tài)交互網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建索引結(jié)構(gòu);索引結(jié)構(gòu)包括:時間維度索引和層次結(jié)構(gòu)索引;基于索引結(jié)構(gòu)查詢以及挖掘k點連通稠密子圖;k點連通稠密子圖用于表征未知的疾病標(biāo)志位點。本發(fā)明從基因組交互網(wǎng)絡(luò)的角度研究復(fù)雜疾病,通過構(gòu)建和分析k點連通稠密子圖,實現(xiàn)未知疾病標(biāo)志位點的挖掘。
本發(fā)明授權(quán)面向基因組動態(tài)交互網(wǎng)絡(luò)的稠密子圖查詢挖掘方法及系統(tǒng)在權(quán)利要求書中公布了:1.一種面向基因組動態(tài)交互網(wǎng)絡(luò)的稠密子圖查詢挖掘方法,其特征在于,包括:基于置換檢驗的方法構(gòu)建基因組動態(tài)交互網(wǎng)絡(luò);所述基因組動態(tài)交互網(wǎng)絡(luò)以SNP位點作為頂點,以位點交互與疾病的關(guān)聯(lián)強(qiáng)度作為邊;基于網(wǎng)絡(luò)存儲模型和網(wǎng)絡(luò)劃分策略,對所述基因組動態(tài)交互網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行分布式存儲;所述網(wǎng)絡(luò)存儲模型包括:分布式文件系統(tǒng)和分布式內(nèi)存系統(tǒng);所述網(wǎng)絡(luò)劃分策略是基于最小點割集的劃分方式確定的;對存儲后的基因組動態(tài)交互網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建索引結(jié)構(gòu);所述索引結(jié)構(gòu)包括:時間維度索引和層次結(jié)構(gòu)索引;基于所述索引結(jié)構(gòu)查詢以及挖掘k點連通稠密子圖;所述k點連通稠密子圖用于表征未知的疾病標(biāo)志位點;k表示稠密子圖的頂點數(shù)目;基于網(wǎng)絡(luò)存儲模型和網(wǎng)絡(luò)劃分策略,對所述基因組動態(tài)交互網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行分布式存儲,具體包括:采用分布式文件系統(tǒng)和分布式內(nèi)存系統(tǒng)的分級存儲策略對所述基因組動態(tài)交互網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行分級存儲;采用基于最小點割集的方式對所述基因組動態(tài)交互網(wǎng)絡(luò)中的網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)進(jìn)行劃分,并將分級存儲后的基因組動態(tài)交互網(wǎng)絡(luò)中連通度高于設(shè)定值的頂點存放在相同的存儲節(jié)點中,以實現(xiàn)基因組動態(tài)交互網(wǎng)絡(luò)的分布式存儲;采用分布式文件系統(tǒng)和分布式內(nèi)存系統(tǒng)的分級存儲策略對所述基因組動態(tài)交互網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行分級存儲,具體包括:將設(shè)定時間之后的基因組動態(tài)交互網(wǎng)絡(luò)表示成一個頂點集合和一個邊集合;采用哈希技術(shù)將頂點集合中的所有頂點分配到分布式內(nèi)存系統(tǒng)中的存儲節(jié)點中;根據(jù)點和邊的映射關(guān)系將邊集合中的所有邊分配到分布式內(nèi)存系統(tǒng)中對應(yīng)的存儲節(jié)點中;對于設(shè)定時間之前的基因組動態(tài)交互網(wǎng)絡(luò),按照時間先后順序定期生成快照,并將歷史快照記錄存放在分布式文件系統(tǒng)中。
如需購買、轉(zhuǎn)讓、實施、許可或投資類似專利技術(shù),可聯(lián)系本專利的申請人或?qū)@麢?quán)人北方工業(yè)大學(xué),其通訊地址為:100144 北京市石景山區(qū)晉元莊路5號;或者聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)官方客服,聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網(wǎng)”。
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