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龍圖騰網恭喜上海歐易生物醫學科技有限公司申請的專利快速批量可自動下載高通量測序數據的方法、系統及應用獲國家發明授權專利權，本發明授權專利權由國家知識產權局授予，授權公告號為：CN117894381B 。

龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-03-21發布的發明授權授權公告中獲悉：該發明授權的專利申請號/專利號為：202410049142.0，技術領域涉及：G16B50/00；該發明授權快速批量可自動下載高通量測序數據的方法、系統及應用是由孫同心;張志康;徐天生;陸瑤;肖云平設計研發完成，并于2024-01-12向國家知識產權局提交的專利申請。

本快速批量可自動下載高通量測序數據的方法、系統及應用在說明書摘要公布了：本發明公開了一種快速批量可自動下載高通量測序數據的方法，所述方法基于snakemake語言和MySQL數據庫，具體包括如下步驟：流程觸發；抓取流程中的樣本信息；上傳樣本信息至MySQL數據庫；自動下載數據庫中標記為wait的樣本；修改數據庫中下載開始后的樣本狀態；下載完畢后將樣本信息同步至MySQL數據庫；修改下載完成的樣本在數據庫狀態；發送下載的匯總郵件；刪除已完工項目的樣本數據。本發明所述方法能夠對樣本進行批量信息同步以及下載，整個過程無需人為介入，能夠自動觸發中間的各個環節。處理過程中會自動將樣本數據的下載匯總信息及時發送給監控人，保證所有操作步驟可溯源，并且借助MySQL數據庫方便各類信息查詢。本發明還公開了實現上述方法的系統以及應用。

本發明授權快速批量可自動下載高通量測序數據的方法、系統及應用在權利要求書中公布了：1.一種基于snakemake語言和MySQL數據庫快速批量可自動下載高通量測序數據的方法，其特征在于，所述方法具體包括如下步驟：步驟一、第一次啟動python腳本立即檢索第一次啟動開始時間至前4個小時內流程中錄入樣本下機數據庫中的下機樣本信息，同時記錄第一次啟動開始時間t0；步驟二、使用python腳本抓取步驟一中獲得的下機樣本信息，將所述下機樣本信息實例化為項目，以項目為單位，獲取對應的項目類型，多個節點實時的cpu及mem信息，判斷后續進行下載分析的節點路徑；步驟三、將步驟二中抓取的樣本信息整理成固定表格的形式，使用python連接MySQL數據庫，并將整理好的樣本信息以表格的形式上傳到MySQL數據庫中，并標記下載狀態為等待下載wait；步驟四、預設的自動下載任務以固定時間間隔掃描一次數據庫，當掃描到MySQL數據庫中的樣本信息為wait時，則自動觸發該樣本的自動下載；步驟四中，下載任務的自動觸發通過python腳本實現；所述固定時間間隔為30min；步驟四中，根據樣本下機信息中的下載路徑生成對應的下載命令，更新至數據庫，通過Snakemake流程投遞命令行，使用鏡像實現同時調用不同的下載工具并行下載樣本；所述鏡像是指傳輸數據軟件和進行數據預處理拆分后的多個不同的下載命令運行python環境；步驟五、在觸發樣本下載的同時python腳本將數據庫中已觸發下載的樣本的下載狀態修改為run；步驟六、樣本的高通量測序數據下載任務完成后python腳本連接MySQL數據庫并將該樣本的下載狀態改為done，并等待觸發后續的分析；步驟七、當流程中的所有樣本都下載完成后，python腳本自動的將本次樣本下載的狀態匯總郵件發給任務監控人；步驟八、一次步驟二至步驟七的循環結束后，暫停30秒啟動下一次循環，下一循環的起始時間為tn，讀取上一次的啟動開始時間tn-1，查詢tn-1至tn時間內錄入樣本下機數據庫中的下機樣本信息，若該時間段無新錄入信息，則不記錄tn，若該時間段內有新錄入數據，則更新tn-1為tn。

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