恭喜浙江高美基因科技有限公司任巧玲獲國家專利權
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龍圖騰網恭喜浙江高美基因科技有限公司申請的專利基于DNA甲基化相關系數的互作DNA片段識別方法獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN119560014B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-06-03發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202510097184.6,技術領域涉及:G16B20/30;該發明授權基于DNA甲基化相關系數的互作DNA片段識別方法是由任巧玲;程一航;張斌;孫德強設計研發完成,并于2025-01-22向國家知識產權局提交的專利申請。
本基于DNA甲基化相關系數的互作DNA片段識別方法在說明書摘要公布了:本發明涉及一種基于DNA甲基化相關系數的互作DNA片段識別方法,本發明基于兩個相互作用DNA片段的甲基化率存在高相關來識別相互作用的DNA片段,只需要利用DNA甲基化測序數據,就能識別到所有實驗樣本中可能存在相互作用關系的DNA片段,其相互作用途徑包含空間折疊、DNA環化、轉錄因子結合、RNA干擾等,彌補了Hi?C只能識別染色質空間結構、Chip?seq只能測與特定轉錄因子結合的DNA片段的技術短板,節約了實驗與計算成本。
本發明授權基于DNA甲基化相關系數的互作DNA片段識別方法在權利要求書中公布了:1.一種基于DNA甲基化相關系數的互作DNA片段識別方法,包括:步驟1.對多個DNA片段樣本分別進行DNA甲基化測序獲得多個bed樣本文件;步驟2.將多個bed樣本文件按照共有的CpG位點進行整合,整合成一個bed樣本文件;步驟3.從步驟2整合后的bed樣本文件中,計算每一個CpG位點與其他CpG位點的甲基化率的皮爾遜相關系數;并預設皮爾遜相關系數閾值rthre,DNA片段中相鄰CpG位點之間的最大距離和DNA片段中需要包含的最少CpG位點數;其中,皮爾遜相關系數閾值rthre通過指定t-test的顯著性水平alpha,再根據DNA片段樣本的數目n計算,計算公式為: ; ; ;式中,ft為t分布的概率密度函數,基于t分布的概率密度函數ft求解使t分布的累積概率為時的臨界t值,然后基于計算相關系數閾值rthre;步驟4.設定篩選條件,根據篩選條件判斷所有DNA片段之間是否存在相互作用關系,其中,篩選條件為:DNA片段中所有CpG位點與其他DNA片段中所有CpG位點之間的皮爾遜相關系數絕對值≥rthre;DNA片段中相鄰的CpG位點之間的距離≤;DNA片段中包含的CpG位點數≥;滿足上述篩選條件的DNA片段之間存在相互作用關系,并整合所有存在相互作用關系的DNA片段得到一組互作bed文件。
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