恭喜昆明理工大學彭瑋獲國家專利權
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龍圖騰網恭喜昆明理工大學申請的專利一種基于多網絡圖卷積的癌癥驅動基因識別方法獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN115019883B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-05-23發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202210131034.9,技術領域涉及:G16B20/20;該發明授權一種基于多網絡圖卷積的癌癥驅動基因識別方法是由彭瑋;唐琦;戴偉設計研發完成,并于2022-02-13向國家知識產權局提交的專利申請。
本一種基于多網絡圖卷積的癌癥驅動基因識別方法在說明書摘要公布了:本發明涉及一種基于多網絡圖卷積的癌癥驅動基因識別方法,屬于系統生物學技術領域。本發明首先根據蛋白質相互作用網絡得到結構網絡,再為每個基因計算出增強特征,根據基因的生物特征之間的相似度得到特征網絡,然后將結構網絡、特征網絡和生物特征放入多網絡圖卷積模型中,對模型進行訓練,并利用訓練好的模型預測新的癌癥驅動基因,最后輸出每個基因是否是癌癥驅動基因的預測分數。本發明通過多網絡圖卷積識別方法,提高機器學習模型預測癌癥驅動基因識別的準確性。
本發明授權一種基于多網絡圖卷積的癌癥驅動基因識別方法在權利要求書中公布了:1.一種基于多網絡圖卷積的癌癥驅動基因識別方法,其特征在于:Step1:根據蛋白質相互作用網絡得到結構網絡;Step2:為每個基因計算出增強特征;Step3:根據基因的生物特征之間的相似度得到特征網絡;Step4:將結構網絡、特征網絡和生物特征放入多網絡圖卷積模型中,對模型進行訓練,并利用訓練好的模型預測新的癌癥驅動基因;Step5:輸出每個基因是否是癌癥驅動基因的預測分數;所述Step2具體為:首先求取基因的差異甲基化率,即一個癌癥類型的所有樣本中,癌癥和匹配正常樣本之間甲基化信號差異的平均值: 式中,表示基因i在癌癥c型中的甲基化值,和是癌癥和匹配正常樣品中的甲基化信號,Sc表示癌癥的樣本集;然后獲取每個基因的差異表達率,每個基因的差異表達率是通過其在癌癥中的表達值與正常樣本之間的對數倍變化來測量的,然后在所有樣本中取平均值;最后,在結構網絡中使用deepwalk算法得到每個基因的包含深層關聯關系的網絡結構特征,然后將其與每個基因在N種癌癥中的突變率、差異甲基化率、差異表達率串聯在一起,并進行最小最大規范化,得到每個基因的增強特征;所述Step4中所使用的多網絡圖卷積模型是基于使用切比雪夫算子的圖卷積層,輸入為節點特征,以及結構網絡和特征網絡,將節點特征、結構網絡,節點特征、特征網絡分別輸入兩組圖卷積,并對經過兩組圖卷積得到的嵌入矩陣進行一致性約束,最后通過特征拼接、全連接層得到并輸出預測分數。
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