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恭喜江南大學陳璟獲國家專利權

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龍圖騰網恭喜江南大學申請的專利一種蛋白質相互作用預測方法、裝置及存儲介質獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN116259358B 。

龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-05-13發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202211678119.5,技術領域涉及:G16B15/30;該發明授權一種蛋白質相互作用預測方法、裝置及存儲介質是由陳璟;曹漢童;任利軍設計研發完成,并于2022-12-26向國家知識產權局提交的專利申請。

一種蛋白質相互作用預測方法、裝置及存儲介質在說明書摘要公布了:本發明涉及生物學技術領域,尤其是指一種蛋白質相互作用預測方法、裝置、設備及存儲介質。本發明所述的蛋白質相互作用預測方法,通過調整Doc2vec非監督段落向量學習模型,將不定長的蛋白質序列特征信息嵌入至低維向量空間,能夠處理任意長度的蛋白質序列,解決了蛋白質初步特征選取問題,利用圖同構卷積網絡的優勢,充分結合蛋白質相互作用PPI網絡結構的信息,聚合每個蛋白質的相鄰蛋白質的信息,優化了蛋白質節點的編碼表征,根據PPI網絡結構信息,找到蛋白質相互作用邊,結合兩個蛋白質節點信息,并不斷從中學習更高效且準確的分類預測,提高了模型預測的準確度。

本發明授權一種蛋白質相互作用預測方法、裝置及存儲介質在權利要求書中公布了:1.一種蛋白質相互作用預測方法,其特征在于,包括:獲取蛋白質相互作用網絡中第i個蛋白質的氨基酸序列,i=1...n,n為蛋白質相互作用網絡中的蛋白質總數;以氨基酸序列的第j個氨基酸為起始,依次向后截取多個k-mer,直至剩下的氨基酸個數k,得到第j個氨基酸子序列,j=1...k;利用Doc2vec模型預測第j個氨基酸子序列中每個滑動窗口中的中央k-mer,并進行聚合操作,得到第j個氨基酸子序列特征,包括:對第j個氨基酸子序列和其在第t個滑動窗口中的上下文k-mer的嵌入編碼求取平均值,根據所述平均值進行分類預測,得到第j個氨基酸子序列中的第t個滑動窗口中的中央k-mer;將k個氨基酸子序列特征進行均值操作,得到第i個蛋白質特征后,將第i個蛋白質特征輸入堆疊的一維卷積網絡處理,其中每一層一維卷積網絡的處理過程為:將上一層一維卷積網絡的輸出作為當前層一維卷積網絡的輸入,將輸入進行多次卷積操作后,經過Relu激活函數和最大池化層處理,得到當前一維卷積網絡的輸出;將經過堆疊的一維卷積網絡處理后的第i個蛋白質特征,經過全連接層處理;使用圖同構卷積網絡將第i個蛋白質多個鄰居蛋白質的特征聚合到自身,得到更新后的第i個蛋白質特征,重復該步驟多次,得到第i個蛋白質聚合特征;將第i個蛋白質聚合特征和與其形成相互作用的蛋白質聚合特征進行點積后輸入分類器,得到第i個蛋白質相互作用的預測結果。

如需購買、轉讓、實施、許可或投資類似專利技術,可聯系本專利的申請人或專利權人江南大學,其通訊地址為:214122 江蘇省無錫市濱湖區蠡湖大道1800號;或者聯系龍圖騰網官方客服,聯系龍圖騰網可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網”。

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