恭喜天津諾禾致源生物信息科技有限公司趙勇獲國家專利權
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龍圖騰網恭喜天津諾禾致源生物信息科技有限公司申請的專利基因組的組裝方法及裝置、計算機可讀存儲介質、處理器獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN113918355B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-04-01發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202111417602.3,技術領域涉及:G06F9/52;該發明授權基因組的組裝方法及裝置、計算機可讀存儲介質、處理器是由趙勇;周勛;田仕林;王龍;陶琳娜設計研發完成,并于2021-11-25向國家知識產權局提交的專利申請。
本基因組的組裝方法及裝置、計算機可讀存儲介質、處理器在說明書摘要公布了:本發明公開了一種基因組的組裝方法及裝置、計算機可讀存儲介質、處理器。其中,該方法包括:響應于第一命令,以利用原始測序數據生成預定數據庫;響應于第二命令,基于多個文件生成多個區塊;響應于第三命令,獲取多個區塊內的目標數據,以基于目標數據得到目標文件;響應于第四命令,生成獨占鎖;在確定當前存在正在運行的文件時,鎖定其他文件,以對正在運行的文件進行處理;在確定正在運行文件處理結束時,釋放獨占鎖,以基于目標文件對原始測序數據進行處理,得到目標基因組。本發明解決了相關技術中對基因組組裝時,由于受到計算機集群帶寬和硬盤的速度限制,使得組裝效率比較低的技術問題。
本發明授權基因組的組裝方法及裝置、計算機可讀存儲介質、處理器在權利要求書中公布了:1.一種基因組的組裝方法,其特征在于,包括:響應于第一命令,以利用原始測序數據生成預定數據庫,其中,所述預定數據庫包括多個文件;響應于第二命令,基于所述多個文件生成多個區塊;響應于第三命令,獲取所述多個區塊內的目標數據,以基于所述目標數據得到目標文件;響應于第四命令,生成獨占鎖,其中,所述獨占鎖用于鎖定除當前正在運行的文件外的其他文件;在確定當前存在所述正在運行的文件時,鎖定所述其他文件,以對所述正在運行的文件進行處理;在確定所述正在運行文件處理結束時,釋放所述獨占鎖,以基于所述目標文件對所述原始測序數據進行處理,得到目標基因組;響應于第三命令,獲取所述多個區塊內的目標數據,以基于所述目標數據得到目標文件,包括:響應于所述第三命令,獲取所述多個區塊中每一個區塊的第一重復序列和第二重復序列;對所述第一重復序列和所述第二重復序列中的預定對象進行屏蔽,得到所述多個區塊中每個區塊內屏蔽后的數據;將所述屏蔽后的數據進行比對,得到目標文件;在確定當前存在所述正在運行的文件時,鎖定所述其他文件,以對所述正在運行的文件進行處理之前,所述方法還包括:判斷預定路徑下是否存在已完成文件,得到判斷結果;在所述判斷結果表示所述預定路徑下存在所述已完成文件時,輸出數據處理完成;在所述判斷結果表示所述預定路徑下不存在所述已完成文件時,繼續獲取所述目標文件。
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