恭喜深圳大學黃裕安獲國家專利權
買專利賣專利找龍圖騰,真高效! 查專利查商標用IPTOP,全免費!專利年費監控用IP管家,真方便!
龍圖騰網恭喜深圳大學申請的專利一種用于預測轉錄因子-靶基因相互作用的方法及模型獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN114420203B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-05-13發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202111493609.3,技術領域涉及:G16B20/00;該發明授權一種用于預測轉錄因子-靶基因相互作用的方法及模型是由黃裕安;潘貴青;王佳;林秋鎮;李堅強設計研發完成,并于2021-12-08向國家知識產權局提交的專利申請。
本一種用于預測轉錄因子-靶基因相互作用的方法及模型在說明書摘要公布了:本發明公開的一種用于預測轉錄因子?靶基因相互作用的方法及模型,所述用于預測轉錄因子?靶基因相互作用的方法是基于隨機游走的異構圖嵌入算法來預測TF與靶基因潛在的相互作用關系,采用隨機游走方式在異構圖中生成節點的語句,然后采用滑動窗口方式提取訓練樣本,經過異構圖嵌入算法生成節點的特征,進而預測TF與靶基因之間未被發現的相互作用關系。并且,由于本發明在異構圖中添加了TG節點,采用隨機游走生成樣本路徑的過程中,在選擇TG或者疾病節點時,設定一個概率,以一定概率選擇TG或者疾病,在解決冷啟動問題的同時,能夠更好地捕獲異構網絡的節點信息。
本發明授權一種用于預測轉錄因子-靶基因相互作用的方法及模型在權利要求書中公布了:1.一種用于預測轉錄因子-靶基因相互作用的方法,其特征在于,具體包括步驟:從基因數據庫提取轉錄因子與靶基因的連接和從疾病數據庫提取基因與疾病的連接,構建一個三種節點類型的第一異構網絡;假設轉錄因子與目標基因之間的節點為TG,所述第一異構網絡與所述節點TG形成第二異構網絡;采用基于元路徑的隨機游走方式,從所述第二異構網絡生成樣本路徑;基于所述樣本路徑構建圖嵌入模型,給定樣本對節點,利用所述圖嵌入模型將所述樣本對節點的嵌入向量連接起來作為全連接層的輸入,獲得所述節點的結果;根據所述結果從所述第二異構網絡中獲得所述節點最終的嵌入,分別形成轉錄因子嵌入矩陣F和靶基因的嵌入矩陣G,計算兩個矩陣的點積獲得預測得分矩陣R,其中第i行第j列的值表示第i個轉錄因子與第j個靶基因的預測得分;所述元路徑的表示形式為其中表示兩個不同類型節點V1和Vn之間的關聯;根據所述元路徑的表示形式,計算第k步轉移的概率p,其公式如下: 其中表示節點的Vt+1類型的相鄰節點;所述圖嵌入模型由第一神經網絡模型和第二神經網絡模型組成;所述第一神經網絡模型包括構建模型和通過所述模型獲得節點嵌入;所述第二神經網絡模型用于計算一對節點嵌入之間的相似度。
如需購買、轉讓、實施、許可或投資類似專利技術,可聯系本專利的申請人或專利權人深圳大學,其通訊地址為:518060 廣東省深圳市南山區南海大道3688號;或者聯系龍圖騰網官方客服,聯系龍圖騰網可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網”。
1、本報告根據公開、合法渠道獲得相關數據和信息,力求客觀、公正,但并不保證數據的最終完整性和準確性。
2、報告中的分析和結論僅反映本公司于發布本報告當日的職業理解,僅供參考使用,不能作為本公司承擔任何法律責任的依據或者憑證。