蘇州大學祝坤獲國家專利權
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龍圖騰網獲悉蘇州大學申請的專利基于迭代k-mer分解的基因組組裝方法及系統獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN119360966B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-04-04發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202411915277.7,技術領域涉及:G16B30/20;該發明授權基于迭代k-mer分解的基因組組裝方法及系統是由祝坤;孫玉娥;杜揚;黃河設計研發完成,并于2024-12-24向國家知識產權局提交的專利申請。
本基于迭代k-mer分解的基因組組裝方法及系統在說明書摘要公布了:本發明涉及計算機技術領域,具體提供了基于迭代k?mer分解的基因組組裝方法及系統,方法包括根據序列長度處理序列片段集合,得到頻數集合;首個序列長度為輸入的序列片段集合的最大序列長度;根據預設頻數閾值劃分頻數集合,得到高頻集合和低頻集合;判斷預設長度閾值和序列長度大小;若預設長度閾值不大于序列長度,將低頻集合作為新序列片段集合,對序列長度進行減值操作,根據減值操作得到的序列長度,處理新序列片段集合,得到新序列片段集合對應的新高頻集合和低頻集合;若預設長度閾值大于序列長度,根據得到的多個高頻集合構建德布魯因圖,根據德布魯因圖輸出組裝序列集合。本發明有效降低計算負擔、提高組裝速度和組裝質量。
本發明授權基于迭代k-mer分解的基因組組裝方法及系統在權利要求書中公布了:1.一種基于迭代k-mer分解的基因組組裝方法,其特征在于,包括:根據序列長度處理序列片段集合,得到頻數集合;其中,包括根據所述序列長度,提取所述序列片段集合中的每個序列片段,得到每個所述序列片段所對應的連續核苷酸序列和連續核苷酸序列個數;建立所述連續核苷酸序列和所述連續核苷酸序列個數之間的映射關系,得到所述頻數集合;首個所述序列長度為輸入的所述序列片段集合的最大序列長度;根據預設頻數閾值,劃分所述頻數集合,得到高頻集合和低頻集合;判斷預設長度閾值和所述序列長度的大小;若所述預設長度閾值不大于所述序列長度,則將所述低頻集合作為新的所述序列片段集合,對所述序列長度進行減值操作,根據減值操作得到的所述序列長度,處理新的所述序列片段集合,以得到新的所述序列片段集合所對應的新的高頻集合和低頻集合;若所述預設長度閾值大于所述序列長度,則根據得到的多個所述高頻集合構建德布魯因圖,并根據所述德布魯因圖輸出組裝序列集合。
如需購買、轉讓、實施、許可或投資類似專利技術,可聯系本專利的申請人或專利權人蘇州大學,其通訊地址為:215000 江蘇省蘇州市吳江區久泳西路1號;或者聯系龍圖騰網官方客服,聯系龍圖騰網可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網”。
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