蘇州大學(xué)祝坤獲國(guó)家專利權(quán)
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龍圖騰網(wǎng)獲悉蘇州大學(xué)申請(qǐng)的專利基于迭代k-mer分解的基因組組裝方法及系統(tǒng)獲國(guó)家發(fā)明授權(quán)專利權(quán),本發(fā)明授權(quán)專利權(quán)由國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局授予,授權(quán)公告號(hào)為:CN119360966B 。
龍圖騰網(wǎng)通過(guò)國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局官網(wǎng)在2025-04-04發(fā)布的發(fā)明授權(quán)授權(quán)公告中獲悉:該發(fā)明授權(quán)的專利申請(qǐng)?zhí)?專利號(hào)為:202411915277.7,技術(shù)領(lǐng)域涉及:G16B30/20;該發(fā)明授權(quán)基于迭代k-mer分解的基因組組裝方法及系統(tǒng)是由祝坤;孫玉娥;杜揚(yáng);黃河設(shè)計(jì)研發(fā)完成,并于2024-12-24向國(guó)家知識(shí)產(chǎn)權(quán)局提交的專利申請(qǐng)。
本基于迭代k-mer分解的基因組組裝方法及系統(tǒng)在說(shuō)明書(shū)摘要公布了:本發(fā)明涉及計(jì)算機(jī)技術(shù)領(lǐng)域,具體提供了基于迭代k?mer分解的基因組組裝方法及系統(tǒng),方法包括根據(jù)序列長(zhǎng)度處理序列片段集合,得到頻數(shù)集合;首個(gè)序列長(zhǎng)度為輸入的序列片段集合的最大序列長(zhǎng)度;根據(jù)預(yù)設(shè)頻數(shù)閾值劃分頻數(shù)集合,得到高頻集合和低頻集合;判斷預(yù)設(shè)長(zhǎng)度閾值和序列長(zhǎng)度大小;若預(yù)設(shè)長(zhǎng)度閾值不大于序列長(zhǎng)度,將低頻集合作為新序列片段集合,對(duì)序列長(zhǎng)度進(jìn)行減值操作,根據(jù)減值操作得到的序列長(zhǎng)度,處理新序列片段集合,得到新序列片段集合對(duì)應(yīng)的新高頻集合和低頻集合;若預(yù)設(shè)長(zhǎng)度閾值大于序列長(zhǎng)度,根據(jù)得到的多個(gè)高頻集合構(gòu)建德布魯因圖,根據(jù)德布魯因圖輸出組裝序列集合。本發(fā)明有效降低計(jì)算負(fù)擔(dān)、提高組裝速度和組裝質(zhì)量。
本發(fā)明授權(quán)基于迭代k-mer分解的基因組組裝方法及系統(tǒng)在權(quán)利要求書(shū)中公布了:1.一種基于迭代k-mer分解的基因組組裝方法,其特征在于,包括:根據(jù)序列長(zhǎng)度處理序列片段集合,得到頻數(shù)集合;其中,包括根據(jù)所述序列長(zhǎng)度,提取所述序列片段集合中的每個(gè)序列片段,得到每個(gè)所述序列片段所對(duì)應(yīng)的連續(xù)核苷酸序列和連續(xù)核苷酸序列個(gè)數(shù);建立所述連續(xù)核苷酸序列和所述連續(xù)核苷酸序列個(gè)數(shù)之間的映射關(guān)系,得到所述頻數(shù)集合;首個(gè)所述序列長(zhǎng)度為輸入的所述序列片段集合的最大序列長(zhǎng)度;根據(jù)預(yù)設(shè)頻數(shù)閾值,劃分所述頻數(shù)集合,得到高頻集合和低頻集合;判斷預(yù)設(shè)長(zhǎng)度閾值和所述序列長(zhǎng)度的大小;若所述預(yù)設(shè)長(zhǎng)度閾值不大于所述序列長(zhǎng)度,則將所述低頻集合作為新的所述序列片段集合,對(duì)所述序列長(zhǎng)度進(jìn)行減值操作,根據(jù)減值操作得到的所述序列長(zhǎng)度,處理新的所述序列片段集合,以得到新的所述序列片段集合所對(duì)應(yīng)的新的高頻集合和低頻集合;若所述預(yù)設(shè)長(zhǎng)度閾值大于所述序列長(zhǎng)度,則根據(jù)得到的多個(gè)所述高頻集合構(gòu)建德布魯因圖,并根據(jù)所述德布魯因圖輸出組裝序列集合。
如需購(gòu)買、轉(zhuǎn)讓、實(shí)施、許可或投資類似專利技術(shù),可聯(lián)系本專利的申請(qǐng)人或?qū)@麢?quán)人蘇州大學(xué),其通訊地址為:215000 江蘇省蘇州市吳江區(qū)久泳西路1號(hào);或者聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)官方客服,聯(lián)系龍圖騰網(wǎng)可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網(wǎng)”。
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