恭喜武漢華大基因技術服務有限公司鄧天全獲國家專利權
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龍圖騰網恭喜武漢華大基因技術服務有限公司申請的專利一種使用短讀長序列糾錯長讀長組裝結果的方法和裝置獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN113012758B 。
龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-06-17發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202110452532.9,技術領域涉及:G16B30/00;該發明授權一種使用短讀長序列糾錯長讀長組裝結果的方法和裝置是由鄧天全;楊林峰設計研發完成,并于2021-04-26向國家知識產權局提交的專利申請。
本一種使用短讀長序列糾錯長讀長組裝結果的方法和裝置在說明書摘要公布了:本申請公開了一種使用短讀長序列糾錯長讀長組裝結果的方法和裝置。本申請的方法包括,切割步驟,以固定閾值對長讀長組裝結果進行切分,獲得切分后的長讀長組裝結果;以及后續的基于切分后的長讀長組裝結果進行的長讀長組裝結果建庫步驟、比對步驟、比對結果匹配步驟、比對結果轉換和排序步驟、比對結果建庫步驟、長讀長組裝結果糾錯步驟,最終合并糾錯結果,獲得糾錯后的長讀長組裝結果。本申請的方法,可使用小內存節點進行糾錯,大幅降低了內存峰值,解決沒有大內存節點無法進行糾錯的問題,降低了長度長組裝結果的糾錯成本;并且,在資源充足情況下,本申請的糾錯方法和裝置還可以并行執行,降低執行時間,提供糾錯效率。
本發明授權一種使用短讀長序列糾錯長讀長組裝結果的方法和裝置在權利要求書中公布了:1.一種使用短讀長序列糾錯長讀長組裝結果的方法,其特征在于:包括以下步驟, 切割步驟,包括以固定閾值對長讀長組裝結果進行切分,獲得切分后的長讀長組裝結果; 長讀長組裝結果建庫步驟,包括對切分后的長讀長組裝結果進行建庫,獲得切分后的長讀長組裝結果庫; 比對步驟,包括將短讀長序列比對到所述切分后的長讀長組裝結果庫中,獲得比對結果; 比對結果匹配步驟,包括將所述比對步驟獲得的比對結果匹配到所述切分后的長讀長組裝結果庫中,獲得含有匹配信息的比對結果; 比對結果轉換和排序步驟,包括將所述含有匹配信息的比對結果轉換成bam格式,并排序; 比對結果建庫步驟,包括對排序后的轉換成bam格式的比對結果進行建庫,獲得比對結果庫; 長讀長組裝結果糾錯步驟,包括采用所述比對結果庫對所述切分后的長讀長組裝結果庫進行糾錯,獲得糾錯結果; 合并糾錯結果步驟,包括合并糾錯結果,獲得糾錯后的長讀長組裝結果。
如需購買、轉讓、實施、許可或投資類似專利技術,可聯系本專利的申請人或專利權人武漢華大基因技術服務有限公司,其通訊地址為:430075 湖北省武漢市武漢東湖新技術開發區高新大道666號武漢國家生物產業基地項目B、C、D區研發樓B2棟;或者聯系龍圖騰網官方客服,聯系龍圖騰網可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網”。
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