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恭喜東華理工大學南昌校區陳軍獲國家專利權

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龍圖騰網恭喜東華理工大學南昌校區申請的專利一種定量鑒定基因交互強度的方法獲國家發明授權專利權,本發明授權專利權由國家知識產權局授予,授權公告號為:CN119943159B

龍圖騰網通過國家知識產權局官網在2025-06-13發布的發明授權授權公告中獲悉:該發明授權的專利申請號/專利號為:202510425447.1,技術領域涉及:G16B40/00;該發明授權一種定量鑒定基因交互強度的方法是由陳軍;翟文;陳倫林設計研發完成,并于2025-04-07向國家知識產權局提交的專利申請。

一種定量鑒定基因交互強度的方法在說明書摘要公布了:本發明公開了一種定量鑒定基因交互強度的方法,包括以下步驟:S1、Hi?C文庫構建及測序;S2、數據質控和比對;S3、未比對reads的切割和重新比對;S4、基因相關區域reads計數;S5、交互強度的定量分析;本發明通過將染色體交互數據轉化為基因與基因之間的交互強度,這樣不僅可以識別不同基因之間的相互作用關系,還能夠對這些相互作用的強度進行量化,為深入理解基因調控網絡和功能研究提供了一種定量化的分析手段。

本發明授權一種定量鑒定基因交互強度的方法在權利要求書中公布了:1.一種定量鑒定基因交互強度的方法,其特征在于,包括以下步驟: S1、Hi-C文庫構建及測序 對待分析的樣本進行Hi-C文庫的構建,應用高通量測序平臺獲取Hi-C數據,獲得的數據為雙端測序reads; S2、數據質控和比對 將獲得的Hi-C測序數據進行質量控制,過濾掉低質量reads,使用bowtie2軟件將質控后的reads比對到參考基因組上,得到比對結果一,并保留未比對上的reads; S3、未比對reads的切割和重新比對 將未比對上的reads采用Hi-C建庫時使用的限制性內切酶的酶切位點進行切割,將切割剩下的reads重新使用bowtie2軟件比對到參考基因組上,得到比對結果二,然后利用samtools軟件將比對結果一和比對結果二合并生成新的bam文件并排序; S4、基因相關區域reads計數 利用注釋文件標注基因相關區域,基因相關區域包括基因的啟動子區域,下游增強子區域,基因body區域,CDS區域,外顯子區域和內含子區域,根據區域坐標統計位置,利用自建python腳本,篩選bam文件,根據基因的調控模式,確保配對的reads一端位于某一基因的上述一個或多個區域,另一端位于其他基因的上述一個或多個區域,統計位于這些基因區域的readscount或者標準化后的readscount,用于評估某一基因到其他基因的交互調控的強度。

如需購買、轉讓、實施、許可或投資類似專利技術,可聯系本專利的申請人或專利權人東華理工大學南昌校區,其通訊地址為:330000 江西省南昌市經濟技術開發區廣蘭大道418號;或者聯系龍圖騰網官方客服,聯系龍圖騰網可撥打電話0551-65771310或微信搜索“龍圖騰網”。

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